Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp25P57080 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp25P57080 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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