Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FusP56959 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FusP56959 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FusP56959 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FusP56959 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms