Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lim2P56563 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lim2P56563 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms