Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gp1bbP56400 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms