Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GferP56213 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GferP56213 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GferP56213 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GferP56213 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GferP56213 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GferP56213 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GferP56213 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GferP56213 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GferP56213 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GferP56213 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GferP56213 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GferP56213 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GferP56213 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GferP56213 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GferP56213 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GferP56213 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GferP56213 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GferP56213 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GferP56213 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GferP56213 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GferP56213 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms