Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GemP55041 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GemP55041 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GemP55041 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GemP55041 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GemP55041 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GemP55041 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GemP55041 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GemP55041 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GemP55041 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GemP55041 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GemP55041 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GemP55041 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms