Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ephb3P54754 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ephb3P54754 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms