Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms