Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpbP50405 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpbP50405 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpbP50405 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpbP50405 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpbP50405 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms