Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtpreP49446 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpreP49446 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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