Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epb42P49222 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms