Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CitP49025 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CitP49025 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CitP49025 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CitP49025 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CitP49025 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CitP49025 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CitP49025 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CitP49025 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CitP49025 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CitP49025 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CitP49025 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CitP49025 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms