Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli1P47806 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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