Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a2P43006 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms