Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ThpoP40226 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms