Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fen1P39749 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms