Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf1P39428 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf1P39428 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms