Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig1P37913 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms