Protein–RNA interactions for Protein: P37242

Thrb, Thyroid hormone receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThrbP37242 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThrbP37242 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThrbP37242 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms