Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs1P35441 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs1P35441 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs1P35441 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms