Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin1P35438 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms