Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab20P35295 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms