Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola1P33609 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms