Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms