Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch4P31695 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch4P31695 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms