Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msr1P30204 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms