Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms