Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtgfP29268 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms