Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms