Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms