Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Etv4P28322 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms