Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa2P28309 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms