Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LoxP28301 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LoxP28301 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LoxP28301 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LoxP28301 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LoxP28301 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LoxP28301 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LoxP28301 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LoxP28301 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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