Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms