Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms