Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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