Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd40lgP27548 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms