Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccnd1P25322 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms