Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms