Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms