Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ggta1P23336 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ggta1P23336 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ggta1P23336 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ggta1P23336 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms