Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms