Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms