Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18528 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18528 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18528 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18528 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18528 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18528 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18528 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18528 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms