Protein–RNA interactions for Protein: P18406

Cyr61, Protein CYR61, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyr61P18406 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyr61P18406 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms