Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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