Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb3P17125 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms