Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms