Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms