Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P10404 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P10404 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P10404 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P10404 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P10404 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms